Về nguyên nhân khách quan: nguồn vốn bội chi ngân sách địa phương chưa phân bổ là 855,6 tỉ đồng do tỉnh đề xuất không phát hành trái phiếu chính quyền địa phương; nguồn nhân lực cấp huyện bố trí thực hiện công tác bồi thường còn ít, không đảm bảo so với nhu cầu giải phóng mặt bằng phục vụ các dự án ngày càng tăng.
Về nguyên nhân chủ quan: thủ tục đầu tư, lựa chọn nhà thầu còn chậm; công tác bồi thường, giải phóng mặt bằng hiện nay còn gặp nhiều vướng mắc, nhất là trong bối cảnh Luật Đất đai 2024 mới có hiệu lực thi hành, một số quy định đang được UBND tỉnh chỉ đạo cơ quan chuyên môn triển khai xây dựng nên cấp huyện chưa có cơ sở triển khai thực hiện công tác bồi thường, hỗ trợ và tái định cư theo quy định.
Cũng theo UBND tỉnh Khánh Hòa, đối với nhóm dự án đầu tư công trọng điểm để lập báo cáo đề xuất chủ trương đầu tư và thực hiện đầu tư giai đoạn 2023-2025, đến nay có 7 dự án đã được cấp có thẩm quyền phê duyệt chủ trương đầu tư và phê duyệt dự án đầu tư, đã bố trí vốn thực hiện đầu tư năm 2024. Cụ thể, gồm: dự án thành phần 1 thuộc dự án đầu tư xây dựng đường bộ cao tốc Khánh Hòa - Buôn Ma Thuột giai đoạn 1; dự án đường giao thông từ QL 27C đến đường tỉnh ĐT.656 tỉnh Khánh Hòa - kết nối với Lâm Đồng và Ninh Thuận; dự án nâng cấp mở rộng cải tuyến tỉnh lộ 1B (đoạn từ nút giao QL 26B đến nút giao tỉnh lộ 1); dự án xây dựng Cung văn hóa thiếu nhi tỉnh Khánh Hòa; dự án xây dựng trụ sở làm việc Tỉnh ủy, Đoàn ĐBQH và HĐND tỉnh, UBND tỉnh; dự án đường giao thông liên vùng H.Diên Khánh và dự án tuyến đường ven biển từ xã Vạn Lương, H.Vạn Ninh đi TX.Ninh Hòa.
Ngoài ra còn có 12 dự án đã được HĐND tỉnh phê duyệt chủ trương đầu tư, hiện nay đang lập hồ sơ báo cáo nghiên cứu khả thi, trình cấp có thẩm quyền phê duyệt dự án đầu tư.
Cùng với đó là 4 dự án đã có kết quả thẩm định báo cáo đề xuất chủ trương đầu tư của Hội đồng thẩm định, hiện nay cơ quan lập báo cáo đề xuất chủ trương đầu tư đang hoàn thiện hồ sơ trình HĐND tỉnh phê duyệt chủ trương đầu tư tại các kỳ họp HĐND tỉnh; 2 dự án đang thực hiện thủ tục lập, thẩm định báo cáo đề xuất chủ trương đầu tư; 8 dự án đang trong quá trình nghiên cứu lập báo cáo đề xuất chủ trương đầu tư.