Đề án kỳ vọng sẽ mang lại hiệu quả KT-XH rất lớn, góp phần nâng cao sức khỏe, tầm vóc, tuổi thọ và chất lượng cuộc sống của người dân TP.HCM nói riêng và trong khu vực nói chung. Đảm bảo đến năm 2030, tuổi thọ trung bình người dân TP.HCM đạt 77, trong đó thời gian sống khỏe mạnh đạt tối thiểu 68 năm. Đạt tỷ lệ 23 bác sĩ/10.000 dân; 40 điều dưỡng/10.000 dân, 42 giường/10.000 dân. Tổng tỷ suất sinh đạt 1,6. Mỗi người dân được khám sức khỏe và tầm soát bệnh 1 lần/năm và được lập hồ sơ sức khỏe điện tử.
Theo đề án, TP.HCM hình thành 3 cụm y tế chuyên sâu: Cụm y tế chuyên sâu khu vực trung tâm, Cụm y tế chuyên sâu Tân Kiên (xã Tân Kiên, H.Bình Chánh) và Cụm y tế chuyên sâu TP.Thủ Đức.
Trong đó, Cụm y tế chuyên sâu khu vực trung tâm TP.HCM gồm Trường ĐH Y Dược TP.HCM, các bệnh viện (BV) trực thuộc Bộ Y tế, Bộ Quốc phòng, các BV đa khoa, chuyên khoa của thành phố hiện hữu, Trung tâm cấp cứu 115... Cụm y tế này giữ vai trò chủ lực trong phát triển các kỹ thuật chuyên sâu, hiện đại ngang tầm các nước trong khu vực đáp ứng nhu cầu khám chữa bệnh của người dân trong và ngoài nước. Ngoài ra, tiếp tục hỗ trợ, chuyển giao kỹ thuật cho các BV tỉnh, thành khu vực phía nam, đồng thời chịu trách nhiệm hỗ trợ chuyên môn để phát triển 2 cụm y tế chuyên sâu tại H.Bình Chánh và TP.Thủ Đức.
Cụm y tế chuyên sâu Tân Kiên có diện tích hơn 74 ha, gồm cơ sở mới của Trường ĐH Y khoa Phạm Ngọc Thạch, BV thực hành của trường và các BV đa khoa, chuyên khoa hiện hữu, các BV đang chuẩn bị đầu tư. Ngoài ra, trên địa bàn H.Bình Chánh trong tương lai sẽ có thêm BV Chợ Rẫy 2, BV Nội tiết T.Ư.
Cụm y tế chuyên sâu TP.Thủ Đức có diện tích hơn 121 ha, gồm Trường ĐH Sức khỏe (thuộc ĐHQG TP.HCM) và BV thực hành của trường; các BV đa khoa, chuyên khoa hiện hữu và phát triển thêm một số BV đa khoa và chuyên khoa nhằm giảm tải cho các BV ở khu vực trung tâm. Ưu tiên xây dựng mới BV chuyên khoa Tâm thần, BV TP.Thủ Đức...